Forum ini dipimpin oleh seorang Ketua dan dibantu oleh Dewan Pertimbangan. Di tingkat Pusat dijalankan oleh sekretariat yang ada di Perkumpulan Pemberantasan TB Indonesia (PPTI) Pusat di Jakarta, dan didukung oleh 5 kelompok kerja yang berperan untuk membantu program yang ada di Pemerintah yaitu Komunikasi Publik, Advokasi, Layanan Klinik, Komunitas dan Mobilisasi Sumber Daya.